Das geht entweder mit btrfs oder rsync.
Beiträge von Berny23 im Thema „Ext4 vs. BTRFS: Welches Dateisystem sollte ich nutzen? Welches nutzt ihr?“
Schon so früh aus den Federn, Gast? Schön, dass Du hereinschaust! Einen angenehmen Aufenthalt wünscht das CompiWare-Team. 
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Sicherst du immer das komplette System? Oder nutzt du so etwas wie Snapshots?
Snapshots.
Tägliche automatische Systemsicherung mit Timeshift im Hintergrund (alles außer /home), damit ich jederzeit Updates in Arch Linux machen und notfalls auf den Systemstand von gestern zurückkehren kann. Der Fall ist bisher nur eingetreten, als ich absichtlich herumexperimentiert habe.
Dann noch monatlich eine Sicherung aller Nutzerdaten in /home mit Back In Time. Das passiert nicht automatisch, sondern ich starte es einmal pro Monat am Freitag, wenn ich den PC für ca. 30 Minuten nicht brauche.
Beide Tools arbeiten mit Hardlinks auf der Backup-SSD, sodass doppelte Dateien nur einmal Speicher belegen und ich alte Sicherungen gefahrlos löschen kann.
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Immer ext4, da ich ausschließlich nach extern sichere und nicht auf derselben SSD, wo die Daten herkommen.
Und bei den ganzen Spielen, Bildern, Dokumenten, Entwicklertools, KI-Tools, Musik usw. bleibt selbst mit ext4 nur gerade etwas über 100 GB von 2 TB übrig.